More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3633 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  40.45 
 
 		 1003 aa  725    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1010 aa  2039    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  37.45 
 
 		 1010 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  36.1 
 
 		 1006 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  35.68 
 
 		 1031 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.62 
 
 		 1043 aa  499  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1181 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 1049 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1161 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1064 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1012 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 1026 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 1011 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1060 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 1122 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1085 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1062 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1124 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 1050 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 986 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1033 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1066 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1037 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1175 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 989 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1038 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1116 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1082 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.88 
 
 		 1002 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1177 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1071 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 1177 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 982 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1164 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.77 
 
 		 1023 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1155 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1004 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1079 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  32.11 
 
 		 1005 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1084 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 1025 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1023 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.12 
 
 		 1063 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1189 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1079 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 1128 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1102 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1161 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 996 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 1020 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1139 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.72 
 
 		 1041 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1008 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 996 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 994 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 1029 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1039 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1114 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1130 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1036 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1020 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  31.98 
 
 		 1000 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1023 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1173 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1027 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1148 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1076 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1026 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1128 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1127 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 1047 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1052 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1179 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1075 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1202 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1034 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 1038 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1163 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 1144 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1051 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1006 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1155 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1051 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1058 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1192 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1006 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1076 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1040 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1019 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1031 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1117 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1090 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 1130 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1129 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1043 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1034 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1019 aa  403  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 986 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1017 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>