More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4782 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  38.91 
 
 
1033 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1144 aa  2330    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  35.99 
 
 
1168 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  76.79 
 
 
1102 aa  1736    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 
1017 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  52.98 
 
 
986 aa  1016    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 
1096 aa  673    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  38.86 
 
 
1006 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 
1077 aa  632  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 
996 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 
1034 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 
1106 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  37.26 
 
 
1042 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 
1117 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 
1147 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 
1013 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 
979 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 
1122 aa  559  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 
1146 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 
1155 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 
1097 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 
1114 aa  549  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 
1050 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 
993 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 
1106 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 
1105 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 
1128 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 
1008 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 
1181 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 
1161 aa  526  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 
1087 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 
1038 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 
1177 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  34.1 
 
 
1030 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 
1124 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
1038 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 
1037 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 
1029 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 
1037 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 
1155 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 
1129 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 
1116 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  33.97 
 
 
1034 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
1189 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 
1152 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 
1050 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 
1076 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 
1163 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 
1051 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 
1076 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 
1148 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.71 
 
 
1023 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 
1006 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 
1008 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 
1076 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 
1023 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 
1066 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
994 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
1000 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 
1006 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 
1154 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 
1179 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 
1051 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 
1060 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 
1026 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 
1048 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 
1150 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 
1019 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 
1113 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 
1079 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 
1144 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 
1132 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 
1012 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 
1041 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 
996 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 
1079 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 
1177 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 
1139 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 
1023 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 
1025 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 
1038 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 
982 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 
1120 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 
1060 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1168 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 
1142 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 
1102 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 
1154 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 
1053 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 
1010 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 
1075 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 
1202 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 
1023 aa  433  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 
1027 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
1058 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 
1140 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 
1028 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
1080 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 
1130 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 
1071 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>