More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0782 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
1043 aa  2124    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  44 
 
 
1036 aa  879    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 
1049 aa  629  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  39.09 
 
 
1116 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 
1011 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 
1026 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.46 
 
 
1012 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  36.1 
 
 
1002 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 
1033 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 
1064 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 
1020 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 
989 aa  535  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.6 
 
 
1164 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 
1010 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 
1038 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 
1177 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 
1082 aa  533  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 
1177 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 
1037 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 
1004 aa  519  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 
1006 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 
986 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 
1085 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 
1062 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 
1161 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 
1066 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.62 
 
 
1023 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 
1124 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 
1060 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 
1010 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 
1003 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  34.31 
 
 
1005 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 
982 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 
1075 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 
1128 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1181 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.18 
 
 
1041 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 
1052 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 
1031 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 
1079 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 
1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
1029 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 
1128 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 
1155 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 
1047 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.45 
 
 
1063 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 
1006 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 
1023 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 
1071 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 
1084 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 
1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 
1139 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 
1077 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  32.37 
 
 
1080 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 
1000 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 
1175 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 
1161 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 
1008 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 
1020 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 
1097 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 
1096 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 
1127 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 
1079 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 
1050 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 
1148 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 
1039 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 
1114 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 
1063 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 
1039 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 
1129 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 
1023 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 
1130 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 
1081 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 
1192 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 
1027 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 
1122 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 
1026 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 
1031 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 
1043 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 
1173 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
996 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 
1034 aa  433  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 
1168 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 
1094 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 
1058 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 
1010 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 
1202 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 
1164 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 
1004 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 
1023 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 
1179 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 
1065 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 
1041 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 
1071 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 
1119 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  31.52 
 
 
1018 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 
1130 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 
1137 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 
1083 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
1040 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>