More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5798 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  42.12 
 
 		 1082 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1202 aa  2439    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  46.15 
 
 		 1060 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  39.85 
 
 		 1062 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  43.38 
 
 		 1083 aa  795    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  62.92 
 
 		 1084 aa  1369    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  62.51 
 
 		 1189 aa  1526    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  55.28 
 
 		 1175 aa  1338    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  42 
 
 		 1064 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  40.76 
 
 		 1096 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  39.51 
 
 		 1085 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  40.33 
 
 		 1077 aa  755    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  33.28 
 
 		 1179 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1164 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 1116 aa  539  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1161 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 1177 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1155 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1114 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1006 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1139 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1128 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1117 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 1033 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.99 
 
 		 1023 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1148 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1181 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 1012 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1010 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1052 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1192 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1036 aa  493  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 1026 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1128 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1038 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1177 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1079 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  33.79 
 
 		 1005 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 1144 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1122 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1008 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1047 aa  475  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 1055 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1006 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 1020 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1130 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1097 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1129 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 1049 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1066 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1127 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1017 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1168 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1076 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1076 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1161 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1031 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1051 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1132 aa  453  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1096 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1150 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1034 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1079 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1124 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1058 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1102 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1131 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 1140 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1130 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1155 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1075 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1081 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1168 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1146 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1034 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1142 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 1050 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1076 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 1025 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1116 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1173 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1103 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1038 aa  433  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1152 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1039 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1163 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1144 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1106 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1019 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 		 1043 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1028 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1164 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1026 aa  423  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1042 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1034 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 1029 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1138 aa  420  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.34 
 
 		 1041 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1154 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1031 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>