More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1584 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 1060 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  42.78 
 
 		 1161 aa  790    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  39.6 
 
 		 1029 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  37 
 
 		 1006 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1155 aa  864    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 1148 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  37.29 
 
 		 1124 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  44.39 
 
 		 1181 aa  862    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  42.65 
 
 		 1173 aa  775    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  39.55 
 
 		 1081 aa  683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  40.95 
 
 		 1038 aa  742    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1177 aa  2392    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 1122 aa  787    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  44.72 
 
 		 1071 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  43.01 
 
 		 1079 aa  788    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  37.73 
 
 		 1039 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  39.72 
 
 		 1066 aa  707    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  41.41 
 
 		 1071 aa  768    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.35 
 
 		 1114 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  42.22 
 
 		 1050 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  40.74 
 
 		 1037 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 1132 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  46.95 
 
 		 1066 aa  893    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  39.48 
 
 		 982 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  38.52 
 
 		 1023 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 1019 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 		 1128 aa  675    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 1117 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  38.52 
 
 		 986 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 1116 aa  635  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1097 aa  635  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  37.66 
 
 		 1119 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  37.55 
 
 		 1071 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 1026 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  37.94 
 
 		 1027 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  37.1 
 
 		 1041 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  37.94 
 
 		 1036 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 1079 aa  625  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 1155 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 1140 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1163 aa  616  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.85 
 
 		 1008 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  38.07 
 
 		 1012 aa  615  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1051 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  36.69 
 
 		 1137 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1028 aa  611  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  37.51 
 
 		 1000 aa  606  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1154 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1172 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1192 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 		 1164 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 1039 aa  602  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.92 
 
 		 1023 aa  601  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  36.66 
 
 		 1103 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1058 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 1038 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  36.03 
 
 		 1023 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.34 
 
 		 989 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1010 aa  592  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  36.44 
 
 		 1034 aa  587  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 1025 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  36.1 
 
 		 1082 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  35.63 
 
 		 1063 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 1129 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  35.89 
 
 		 1017 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1152 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1116 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 1051 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1006 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 		 1043 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1064 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1106 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1154 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 1076 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1150 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  35.92 
 
 		 1047 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1059 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1076 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 1154 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 		 1076 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1062 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 1065 aa  559  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1179 aa  559  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 1033 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1127 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 1013 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 1034 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 1020 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 994 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 1014 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1040 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 1128 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1096 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 999 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1052 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1085 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1161 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1096 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1077 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1139 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>