More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3538 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1006 aa  2043    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  39.31 
 
 		 1124 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  49.95 
 
 		 1029 aa  947    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1161 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  37 
 
 		 1177 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  40.27 
 
 		 1038 aa  727    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  42.08 
 
 		 1037 aa  748    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  59.15 
 
 		 1008 aa  1221    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  38.11 
 
 		 1117 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1114 aa  632  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  37.69 
 
 		 1097 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 		 1019 aa  628  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  37.29 
 
 		 1066 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  37.11 
 
 		 1041 aa  606  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  36.12 
 
 		 1039 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  36.55 
 
 		 1028 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1163 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 982 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1155 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 1181 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1006 aa  586  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 1051 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  35.67 
 
 		 1051 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 1128 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 986 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 1000 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1132 aa  579  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1071 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1173 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1023 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1152 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.5 
 
 		 1012 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1010 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 989 aa  547  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1148 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 1014 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1154 aa  549  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1122 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1116 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 1050 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 979 aa  542  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1023 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 1071 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1059 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1096 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1150 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 1038 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 1025 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1103 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 1017 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1079 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.52 
 
 		 1023 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1053 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 1033 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 996 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1147 aa  528  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1081 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1027 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1071 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 1041 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1076 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.98 
 
 		 1063 aa  522  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1013 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1076 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1075 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1042 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1039 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 1026 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 1080 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1036 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1155 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1043 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 994 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1079 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1034 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1164 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1060 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1076 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1010 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1023 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1096 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 1034 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  33.84 
 
 		 1030 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1082 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1116 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 1065 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 999 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 1008 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 1011 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1129 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1154 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1064 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 1175 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1036 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1014 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 996 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1119 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1052 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1168 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>