More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1762 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1023 aa  2069    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  37.46 
 
 		 1137 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1066 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1114 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 		 1117 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  37.12 
 
 		 1005 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 984 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 1037 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  35.89 
 
 		 1037 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 976 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 1094 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 1038 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 1004 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 1025 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  36.49 
 
 		 1047 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 1003 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 1090 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 1029 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 1128 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 1177 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1071 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1161 aa  536  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.96 
 
 		 1041 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 1173 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1155 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.16 
 
 		 1063 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 982 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1097 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 1010 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1027 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1008 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1124 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1103 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 989 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 1000 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1006 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1125 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1147 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 1011 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1012 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1028 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1039 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1181 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 999 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 977 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 988 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 971 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1116 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1094 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 986 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1064 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 1050 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1051 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 996 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1198 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 1038 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1119 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1102 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 994 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 1071 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1053 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1039 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1122 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1023 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1051 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1164 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1155 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1062 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1066 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1132 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1019 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1059 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1129 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1076 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1103 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.88 
 
 		 1002 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.27 
 
 		 1023 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1076 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 999 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1060 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1043 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1006 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1051 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1049 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1075 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 1177 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1036 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 996 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1063 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1163 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1021 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1006 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1096 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1026 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1023 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 979 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1060 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1041 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1085 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>