More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1620 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  52.66 
 
 
1024 aa  1068    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  48.96 
 
 
1019 aa  952    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  54.29 
 
 
999 aa  1099    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1014 aa  2051    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  47.04 
 
 
1120 aa  892    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  51.28 
 
 
1028 aa  1006    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  59.01 
 
 
1043 aa  1205    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  37.98 
 
 
1010 aa  618  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.22 
 
 
1161 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  37.42 
 
 
1027 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 
982 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  35.6 
 
 
986 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 
1023 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 
1071 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.59 
 
 
1008 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 
1071 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 
1037 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 
1006 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 
1177 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1181 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 
1079 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 
1128 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 
1132 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 
1140 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 
1066 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 
1039 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 
1124 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 
1155 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 
989 aa  517  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 
1038 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 
1029 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 
1051 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 
1173 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 
1114 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 
1026 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 
997 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 
1122 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 
1050 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 
1019 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 
1006 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  32.53 
 
 
925 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 
1076 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 
1116 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 
1155 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 
1028 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 
1012 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 
1051 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 
1039 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 
994 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 
1117 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 
1129 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.79 
 
 
1041 aa  469  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 
1064 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 
1163 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 
1148 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 
1096 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 
1076 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 
1070 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 
1154 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 
1103 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
1038 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 
1021 aa  459  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 
1000 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 
996 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 
1076 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 
1082 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 
1164 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.14 
 
 
1063 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 
1152 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 
1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  30.94 
 
 
1047 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 
1059 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
1065 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 
1147 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 
1081 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 
996 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 
1154 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 
1097 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 
1006 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 
1079 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 
1075 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 
1014 aa  438  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 
1154 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 
1050 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 
1025 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 
1137 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  29.84 
 
 
1018 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 
1127 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 
1047 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 
1177 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 
1052 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 
1034 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 
1034 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 
975 aa  428  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 
1013 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 
1198 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 
1059 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 
1179 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 
1168 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 
1060 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>