More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1281 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  49.32 
 
 		 1028 aa  994    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 1161 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  51.8 
 
 		 1096 aa  1026    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  45.48 
 
 		 1059 aa  872    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  47.18 
 
 		 1163 aa  954    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  43.19 
 
 		 1154 aa  867    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  46.1 
 
 		 1150 aa  974    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  37.83 
 
 		 1053 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1114 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1152 aa  2343    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1040 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  47.3 
 
 		 1132 aa  1011    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  49.35 
 
 		 1051 aa  1009    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1155 aa  615  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 1037 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 1049 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 1080 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 		 1038 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 1117 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 1029 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1177 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1116 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1124 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  35.25 
 
 		 1041 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  33.95 
 
 		 1080 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1006 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1181 aa  549  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1008 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1039 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 1000 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 1063 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1071 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1129 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1079 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1096 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1066 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 986 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1128 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1097 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 1050 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 1071 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1021 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1148 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1051 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1122 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 989 aa  511  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 982 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1173 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1154 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1081 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1010 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1039 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1012 aa  498  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1019 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1164 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1102 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.27 
 
 		 1023 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1127 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1027 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1087 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1076 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 1025 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1106 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1076 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1155 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1013 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 999 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1147 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1144 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1006 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1077 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1066 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1113 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1023 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 996 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1052 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 979 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 994 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1036 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 1128 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 1026 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 1140 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1023 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.19 
 
 		 1063 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1139 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1168 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1103 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1076 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1172 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1079 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1042 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1119 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1010 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 1020 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1014 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1006 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1017 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1060 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 986 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>