More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4708 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  41.23 
 
 		 1029 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  38.79 
 
 		 1117 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  53.24 
 
 		 1124 aa  1221    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  39.4 
 
 		 1038 aa  669    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.7 
 
 		 1177 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  41.07 
 
 		 1161 aa  778    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 1122 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  39.49 
 
 		 1114 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  39.96 
 
 		 1037 aa  689    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1155 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  39.72 
 
 		 1008 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 1128 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1097 aa  2234    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  37.69 
 
 		 1006 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  36.06 
 
 		 1116 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1148 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  38.96 
 
 		 1041 aa  614  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  39.4 
 
 		 996 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.64 
 
 		 1000 aa  601  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  37.03 
 
 		 1019 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  37.61 
 
 		 986 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1181 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 		 982 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 994 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 1066 aa  592  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 1026 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1163 aa  581  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 1025 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  36.51 
 
 		 1023 aa  579  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1173 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1155 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1132 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  38.32 
 
 		 1012 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1096 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 989 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 1071 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1039 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 1050 aa  556  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 1038 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1164 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1144 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  36.51 
 
 		 1028 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1051 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1023 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1102 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1154 aa  539  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1023 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1152 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1079 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1051 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1082 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1059 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1081 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1161 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1168 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 979 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1154 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1023 aa  523  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1023 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1129 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1071 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1119 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1085 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1076 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 1177 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1106 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1128 aa  510  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1189 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1060 aa  513  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1103 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1076 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1150 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1076 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1071 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1127 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1064 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1039 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1116 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1017 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1079 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1053 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1147 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1052 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 1034 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1113 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1137 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1006 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1040 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.34 
 
 		 1063 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 1065 aa  493  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1027 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1049 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1179 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1077 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1036 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1050 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1010 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 1041 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1096 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1010 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>