More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0443 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  44.58 
 
 		 986 aa  853    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 989 aa  2015    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 		 1161 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  45.76 
 
 		 982 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.83 
 
 		 1037 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  37.87 
 
 		 999 aa  621  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.9 
 
 		 1124 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  37.1 
 
 		 1114 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1038 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1012 aa  599  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 		 1000 aa  594  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.31 
 
 		 1023 aa  594  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.34 
 
 		 1177 aa  589  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 		 1117 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  37.86 
 
 		 1066 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  37.55 
 
 		 1051 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 1043 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 1029 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  36.31 
 
 		 1028 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 		 1010 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1181 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1052 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.28 
 
 		 1155 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  35 
 
 		 1063 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 1026 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 1019 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 1008 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 1020 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 1097 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  36.95 
 
 		 1163 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1027 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  36.59 
 
 		 1041 aa  548  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  36.01 
 
 		 1023 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1071 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  35.79 
 
 		 1039 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1006 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1039 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1116 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 1036 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 1034 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  34.64 
 
 		 1043 aa  532  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1103 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1066 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1132 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 1050 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1128 aa  526  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1059 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1173 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 996 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 994 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 1014 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  35.07 
 
 		 1002 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 		 1096 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 1140 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1152 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 1164 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 1049 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 1063 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1080 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 1177 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1064 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 1025 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1023 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1085 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1075 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1079 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1116 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  34.03 
 
 		 1024 aa  495  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 1128 aa  496  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 1081 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1119 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1053 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 1154 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1062 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1150 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 1003 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1020 aa  493  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 1041 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1122 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1129 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1076 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1006 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1065 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1155 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1198 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 1071 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 1011 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1076 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 1028 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1003 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1137 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1021 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1040 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1147 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 979 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1120 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1076 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  32.13 
 
 		 1019 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>