More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3282 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  47.94 
 
 		 1064 aa  969    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  37.04 
 
 		 1096 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  37.33 
 
 		 1060 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 1084 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  46.67 
 
 		 1062 aa  962    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  36.63 
 
 		 1077 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  39.23 
 
 		 1175 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  39.54 
 
 		 1189 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  51.08 
 
 		 1082 aa  1066    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 		 1083 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  39.51 
 
 		 1202 aa  690    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1085 aa  2206    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1066 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 1026 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 1047 aa  552  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1038 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1020 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 1177 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 1037 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1181 aa  539  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1177 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1161 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1155 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.79 
 
 		 1012 aa  524  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 1050 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1164 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 1128 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 1029 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1127 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1097 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1055 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33 
 
 		 1043 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.61 
 
 		 1023 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1039 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1010 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1124 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1008 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 989 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1079 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1052 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1036 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1114 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1148 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1192 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 982 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 1034 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1128 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1049 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1161 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1179 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1006 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1010 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1071 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.85 
 
 		 1002 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 1063 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1075 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 1033 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 1038 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1081 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 986 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1079 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 1071 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 994 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1006 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 1010 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  32.59 
 
 		 1005 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1173 aa  459  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 996 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1122 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1116 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1027 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1116 aa  453  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1051 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1023 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1025 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1017 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1147 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1026 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 996 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1071 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 1019 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1004 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1051 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1139 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1058 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1119 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1053 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1129 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.78 
 
 		 1041 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1138 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1137 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1060 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1034 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1028 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1076 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1023 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1103 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1034 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1023 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1076 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>