More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1362 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1140 aa  2313    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 
1177 aa  612  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 
1181 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 
1037 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 
1066 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 
1132 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 
999 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 
982 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 
1155 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 
1114 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 
1161 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 
1116 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 
1038 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 
1129 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 
1014 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 
1029 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 
1012 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 
1023 aa  520  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 
1155 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 
1124 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 
986 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  34.43 
 
 
1019 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
1043 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 
1117 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 
1148 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 
1120 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 
1131 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 
1122 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 
1051 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 
1010 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 
989 aa  509  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 
1027 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 
1154 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 
1150 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.76 
 
 
1041 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 
1173 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 
1127 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 
1019 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 
1028 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 
1026 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 
1075 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 
1039 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 
1050 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 
1008 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 
1076 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 
1079 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 
1192 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 
1076 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 
1039 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 
1079 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 
1071 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 
1006 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 
1071 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 
1038 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  34.46 
 
 
925 aa  476  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 
1071 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 
1103 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
1154 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
1000 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.43 
 
 
1063 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 
1189 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 
1076 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 
1023 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 
1017 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 
1025 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  32.72 
 
 
1024 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 
1146 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 
1077 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 
1051 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 
1066 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 
1028 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 
1152 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.35 
 
 
1023 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 
1097 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 
1116 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 
1160 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 
1163 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
1177 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 
1020 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 
1034 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.72 
 
 
1005 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 
1033 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 
1062 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 
1020 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 
1164 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 
1128 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 
1202 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 
1147 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 
1096 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 
1060 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 
1139 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 
1036 aa  443  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 
1081 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 
1043 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 
1058 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 
1021 aa  438  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 
1059 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 
997 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 
1006 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 
1010 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>