More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3127 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1003 aa  2028    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  66.05 
 
 
1137 aa  1347    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 
1090 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  37.68 
 
 
1005 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 
1125 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  36.55 
 
 
1047 aa  556  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  35.99 
 
 
1103 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 
1023 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 
1119 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 
999 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 
1094 aa  516  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 
989 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 
1161 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 
996 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 
971 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 
1102 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 
1037 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 
1008 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 
1094 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
1029 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 
1006 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 
1004 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32 
 
 
982 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 
988 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 
971 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 
1012 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.89 
 
 
1041 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 
1128 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 
994 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 
1039 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
984 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 
976 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 
1063 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 
986 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 
977 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 
996 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 
975 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 
1051 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 
1155 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
1132 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 
1124 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 
1181 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32 
 
 
1000 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 
1011 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 
1037 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 
1114 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 
979 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 
1025 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1051 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32 
 
 
1043 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 
1012 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 
1117 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
1116 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 
1023 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 
1129 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 
1163 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 
1066 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 
1010 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 
1019 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.32 
 
 
1023 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 
1177 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 
1053 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 
1096 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 
1038 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 
1027 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 
1075 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 
1028 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 
1010 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.24 
 
 
1002 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 
1164 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 
1076 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
1049 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 
1097 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 
1006 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 
1014 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 
999 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 
1071 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 
1076 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 
1148 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 
1152 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 
1080 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 
1155 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 
1008 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 
1031 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 
1122 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
1071 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 
1096 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 
1173 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 
1140 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 
1128 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 
1113 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 
1202 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
1189 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 
1020 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 
1036 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 
1036 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 
1076 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  31.55 
 
 
1000 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 
1063 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>