More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4169 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  40.86 
 
 		 976 aa  658    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 984 aa  652    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1094 aa  2202    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  61.85 
 
 		 1004 aa  1274    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 1011 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1037 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 1012 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1023 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 1090 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.83 
 
 		 1037 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1128 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1161 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 1025 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1177 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 1029 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1066 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  33.95 
 
 		 1005 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1047 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1155 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1124 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1114 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 1003 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 986 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1038 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1097 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 982 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1039 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 989 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 1034 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1137 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.24 
 
 		 1041 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 975 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1019 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1094 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1000 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  32.72 
 
 		 993 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1071 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1132 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1008 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 999 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1006 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.28 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1116 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1117 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1140 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.37 
 
 		 1023 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 1128 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1103 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1172 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1173 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  32.9 
 
 		 1043 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1181 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 996 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  31.94 
 
 		 979 aa  416  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1139 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1198 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1050 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 977 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1071 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1076 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1075 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1036 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1125 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1148 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1027 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1122 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1119 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1147 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1102 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 994 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1021 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1119 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 979 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1006 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1051 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1023 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1012 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1079 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1120 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1006 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  33.26 
 
 		 925 aa  399  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1155 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1154 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1023 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 971 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1150 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1129 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1163 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1014 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1164 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.54 
 
 		 1002 aa  390  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1033 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  30.75 
 
 		 1000 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 		 1047 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1043 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1076 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 999 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1023 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1077 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>