More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0566 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 1094 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  40.38 
 
 		 1037 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 984 aa  1985    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  48.21 
 
 		 1012 aa  901    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 		 976 aa  618  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 1004 aa  598  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  38.4 
 
 		 1011 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1023 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  36.43 
 
 		 1047 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1124 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 1037 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1137 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1003 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 977 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1008 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 986 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1161 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1128 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 982 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 1025 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 988 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1090 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1029 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  31.2 
 
 		 1005 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1038 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1006 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1103 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 999 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 996 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1117 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 971 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 989 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1071 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1155 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1006 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 994 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1177 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1114 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 975 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1125 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1066 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 1034 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1071 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1119 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1097 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1181 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1023 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1043 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 1000 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1031 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  31.29 
 
 		 993 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1012 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1129 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1094 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1014 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1051 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1116 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1021 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1028 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1140 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1019 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1039 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.18 
 
 		 1041 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1059 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 1063 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1122 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1155 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 1175 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1026 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1075 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1076 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1038 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1010 aa  370  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1051 aa  370  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1010 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1103 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.9 
 
 		 1023 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1076 aa  363  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1051 aa  363  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 1154 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1027 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1102 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 971 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1128 aa  357  7.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1148 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1076 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 1050 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  29.49 
 
 		 979 aa  356  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1053 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1198 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 1016 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 1049 aa  351  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1023 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1147 aa  349  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1119 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 999 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 996 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1062 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1150 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>