More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5092 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  42.97 
 
 		 993 aa  727    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  40.82 
 
 		 979 aa  657    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  52.86 
 
 		 977 aa  991    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 988 aa  1998    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  44.39 
 
 		 975 aa  805    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1023 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 1037 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1003 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1125 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  34.21 
 
 		 1005 aa  456  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 1000 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1094 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1137 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1128 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 989 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1155 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1177 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 1029 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1047 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 984 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 994 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 986 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1037 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1038 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1124 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1012 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1155 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1161 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 999 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1094 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1051 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1119 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1116 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 1038 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1132 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 982 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1066 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1114 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1051 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.8 
 
 		 1041 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1023 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 1004 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 996 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 976 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 1090 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 999 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1006 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1039 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 1014 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1012 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 1025 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 1140 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 1011 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1103 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1008 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1059 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1071 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1129 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1019 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1043 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1122 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1066 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1027 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1097 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1006 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1181 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1117 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 1063 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1096 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 971 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1103 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1021 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1139 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1050 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1071 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1017 aa  363  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1177 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1063 aa  361  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1076 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 1026 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 1080 aa  360  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  30.24 
 
 		 1035 aa  359  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1152 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1102 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1079 aa  357  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1043 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1040 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1164 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1172 aa  353  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1102 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1161 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 979 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1154 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1006 aa  351  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1077 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1076 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1079 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>