More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05065 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  44.21 
 
 		 993 aa  796    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  40.92 
 
 		 988 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 		 975 aa  657    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  40.75 
 
 		 977 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  100 
 
 		 979 aa  1967    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 1094 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1023 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1004 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 1090 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 1029 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  31.57 
 
 		 1005 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1011 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1037 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1161 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 976 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 989 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1128 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1038 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  31.19 
 
 		 1035 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1010 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1114 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1066 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1012 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 1003 aa  370  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 984 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 		 1063 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1039 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1008 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.23 
 
 		 1002 aa  363  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1047 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1000 aa  362  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 982 aa  360  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 999 aa  360  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 1128 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1155 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  29.28 
 
 		 1018 aa  358  3.9999999999999996e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1012 aa  357  3.9999999999999996e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1177 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 1063 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1050 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1125 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1177 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 996 aa  351  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1006 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1071 aa  350  6e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 1014 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 1011 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1003 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1053 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 986 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1137 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1103 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1023 aa  347  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 1038 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 1140 aa  347  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 994 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 1019 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1119 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.77 
 
 		 1043 aa  345  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 1023 aa  345  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1034 aa  344  4e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1027 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1124 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1079 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1077 aa  341  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1020 aa  341  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1122 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1137 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1103 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1129 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1036 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1025 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1116 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1043 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1119 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1021 aa  335  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1006 aa  334  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1049 aa  334  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1037 aa  333  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  30.84 
 
 		 1005 aa  333  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1081 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1164 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1039 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1172 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1094 aa  332  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.6 
 
 		 1041 aa  330  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1152 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 		 1030 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1102 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1051 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1147 aa  327  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1096 aa  327  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1139 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1023 aa  327  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 1065 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1051 aa  324  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 999 aa  324  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 996 aa  323  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1173 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1052 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>