More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3871 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1002 aa  2026    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 		 1164 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 1052 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  36.1 
 
 		 1043 aa  552  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.18 
 
 		 1161 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.18 
 
 		 1012 aa  545  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 1020 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.95 
 
 		 1063 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 1026 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  36.33 
 
 		 1023 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.27 
 
 		 1177 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1064 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 1049 aa  516  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 1177 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  33.56 
 
 		 1005 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 1034 aa  510  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 989 aa  512  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1155 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1066 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 1033 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 1000 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1006 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1181 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1008 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1036 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 1128 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1038 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 1011 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1122 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1114 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1039 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1081 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1037 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 1029 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 986 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1161 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1117 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1060 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 982 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1082 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1062 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1079 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1053 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1071 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1085 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1006 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1148 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1027 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 1175 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1116 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.81 
 
 		 1041 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1130 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1139 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 1047 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  32.47 
 
 		 1047 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1060 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1150 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 1189 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 1050 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1103 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1124 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1192 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1039 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1010 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1075 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1023 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1179 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1025 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 994 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1128 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1023 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1079 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 996 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  31.97 
 
 		 1035 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1173 aa  436  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1004 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1058 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1129 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1116 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1003 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1023 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1010 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1038 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1202 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1008 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1028 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 1071 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1065 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1096 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1090 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1066 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1084 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1172 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1130 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1021 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 1063 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 1055 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1014 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1031 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1140 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>