More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1121 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1003 aa  2066    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 1010 aa  711    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1010 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1006 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1012 aa  502  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 1026 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.21 
 
 		 1043 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1181 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1161 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1114 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1031 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 989 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1033 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 986 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1164 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1038 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1004 aa  469  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.26 
 
 		 1023 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1177 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1050 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 1037 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1060 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1039 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1124 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1036 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 1049 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1066 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1116 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 1177 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1084 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1139 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1155 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1079 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1023 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1082 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 1175 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 1011 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.52 
 
 		 1002 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1020 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1071 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 1029 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1128 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 1038 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.03 
 
 		 1005 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 1034 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 1189 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 1047 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1027 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1052 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1000 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.2 
 
 		 1063 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1023 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1008 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1128 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 982 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1039 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1006 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 996 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1122 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1097 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1064 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.04 
 
 		 1041 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1192 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1071 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 1043 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1152 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1130 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1081 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1075 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1137 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1173 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1119 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 996 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1020 aa  406  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1028 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1025 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1202 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1155 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1146 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1040 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1132 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1010 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1117 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1062 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1021 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 994 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1116 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1079 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1129 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1060 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1163 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1148 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 1063 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1172 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1017 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1102 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 1140 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1031 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.72 
 
 		 1030 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1059 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>