More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7234 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  49.69 
 
 		 1125 aa  985    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  48.92 
 
 		 999 aa  923    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  36.12 
 
 		 1094 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1119 aa  2291    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 1103 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  38.64 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1102 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 996 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1137 aa  562  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 1003 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 1090 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 971 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  36.2 
 
 		 1005 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1047 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1023 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1114 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1128 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1097 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 982 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1037 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 977 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 988 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1122 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1161 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 1004 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1116 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1155 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1037 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1129 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 996 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1177 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1113 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 1094 aa  403  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 984 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1181 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1096 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1012 aa  393  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1038 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1029 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1124 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1023 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1028 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 1025 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1172 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1077 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1051 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.69 
 
 		 1063 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 989 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 976 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1010 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1076 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1132 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1102 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1008 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 986 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1155 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1039 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1059 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.28 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 994 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1014 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1154 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1076 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 1038 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1140 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1021 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1049 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1120 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 1019 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1012 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1117 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 1000 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 975 aa  370  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 1063 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1163 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1071 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1139 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1040 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 979 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1013 aa  365  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1076 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1173 aa  364  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.89 
 
 		 1041 aa  360  6e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 1043 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1023 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1066 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1053 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1071 aa  357  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 1144 aa  357  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1152 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1011 aa  357  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1051 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1137 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1050 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1027 aa  354  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1006 aa  353  7e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1006 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1103 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1066 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1119 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>