More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1497 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  39.45 
 
 		 1017 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  54.01 
 
 		 986 aa  1019    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1102 aa  2238    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  37.36 
 
 		 1077 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  37.89 
 
 		 1033 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 1168 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  37.61 
 
 		 1096 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  76.7 
 
 		 1144 aa  1722    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  39.58 
 
 		 1006 aa  632  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  38.33 
 
 		 1034 aa  622  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  37.72 
 
 		 996 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  38.91 
 
 		 1013 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  37.49 
 
 		 1042 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1106 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 1147 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1114 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1181 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1105 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 1117 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1146 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 979 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1106 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1087 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 993 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 1008 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1050 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1161 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1038 aa  529  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1177 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1128 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1155 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1155 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1097 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1124 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1122 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1029 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1116 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 1038 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1037 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  34.81 
 
 		 1034 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1037 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  33.82 
 
 		 1030 aa  496  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1154 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1076 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1152 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1079 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1076 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1148 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 1026 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 1189 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 1050 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1060 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1023 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1051 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 1076 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1051 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1129 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.47 
 
 		 1023 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1163 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1132 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 		 1006 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1066 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1012 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1008 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1048 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1177 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1023 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1006 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1000 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 1041 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1150 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 1041 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 1025 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 982 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 986 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1144 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1179 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1010 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1038 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1075 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 989 aa  442  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1019 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1154 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 994 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1113 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1059 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1064 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1081 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1120 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1202 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1161 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1102 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1066 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1053 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1027 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1023 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 1080 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1071 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1039 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 1071 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>