More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0997 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  47.64 
 
 		 993 aa  874    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  39.47 
 
 		 1087 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 979 aa  1979    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  41.33 
 
 		 1013 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  38.11 
 
 		 1147 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  37.47 
 
 		 1017 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  36.18 
 
 		 1096 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 1034 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 996 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1106 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1006 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1037 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  36.92 
 
 		 1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 1000 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 1144 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 1037 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1102 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1006 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1161 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1050 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1168 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1042 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 986 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 1008 aa  522  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1177 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1146 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 1029 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1066 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 1097 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1048 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.77 
 
 		 1041 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1181 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  35.02 
 
 		 1116 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1008 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1155 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1114 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1051 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 982 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 1128 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  34.02 
 
 		 1030 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1059 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1124 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 1050 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1023 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 1028 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1105 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1173 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1042 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 1071 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1019 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 989 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 1025 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1038 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1039 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1117 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1051 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 1038 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 986 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1039 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1027 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 994 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1012 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1152 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  32.35 
 
 		 1018 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1071 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1079 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1082 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 1132 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1164 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1122 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1066 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1155 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1080 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1150 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1064 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1023 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 1026 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1096 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1163 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1010 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1154 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1021 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 996 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 		 1023 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1031 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1014 aa  435  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1023 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1049 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 1140 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1129 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 1028 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1003 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1053 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1057 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1148 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1023 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1076 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>