More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1390 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1037 aa  2123    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 		 1057 aa  696    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  45.68 
 
 		 1042 aa  852    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  43.36 
 
 		 1038 aa  832    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  36.01 
 
 		 1106 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  35.59 
 
 		 1129 aa  597  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1087 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 979 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1146 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1013 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 993 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1102 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1096 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 1144 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1017 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1034 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1147 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 1050 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 1037 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1168 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1048 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1161 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1042 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 986 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1008 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1155 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1181 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1028 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1006 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1077 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1105 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1076 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1177 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 996 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1038 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1000 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1116 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1114 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1132 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 1071 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1076 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1117 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.89 
 
 		 1041 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1076 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1027 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1008 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1155 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1029 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1051 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1006 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 982 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 994 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1006 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 1025 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 1034 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1079 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1148 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1066 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1066 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1033 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1051 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1129 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.6 
 
 		 1023 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1060 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 996 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1012 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1023 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1075 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1021 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1064 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1122 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1071 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1010 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1152 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1103 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1059 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1079 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1096 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 1026 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.27 
 
 		 1063 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1014 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1039 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1049 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1053 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1113 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1154 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1082 aa  366  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1128 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1031 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1137 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1163 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1039 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 1030 aa  364  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 989 aa  364  4e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1023 aa  364  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1106 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1124 aa  363  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 999 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>