More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2267 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  35.95 
 
 		 1106 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1146 aa  2342    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  37.12 
 
 		 1048 aa  622  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1087 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1144 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1102 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1037 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 979 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  34.79 
 
 		 1013 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1155 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1096 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 993 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1042 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1077 aa  489  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1038 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1177 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1148 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1114 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1122 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1057 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1017 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1097 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1128 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1161 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1181 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 1037 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1168 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 986 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1124 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1050 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1034 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1008 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1147 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1076 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1006 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 1129 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1116 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1155 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1038 aa  413  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1076 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.02 
 
 		 1030 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 982 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1177 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 1000 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 996 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1050 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1076 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1189 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1071 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 986 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1029 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 996 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1042 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 994 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1010 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1066 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1051 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1154 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1113 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1132 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1128 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.34 
 
 		 1041 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1105 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1079 aa  390  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1028 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1173 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1161 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1202 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1012 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1010 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1142 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 1014 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1150 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1053 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1168 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 1019 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1006 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1152 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1059 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1079 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1008 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 1023 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1066 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1129 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 1144 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1071 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1163 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1138 aa  366  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1120 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1127 aa  365  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1064 aa  365  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1062 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 1026 aa  361  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1071 aa  360  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1192 aa  360  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  28.85 
 
 		 1034 aa  360  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1058 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1027 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1051 aa  357  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1137 aa  357  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>