More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2219 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1106 aa  2253    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  39.14 
 
 		 1087 aa  754    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  36.18 
 
 		 1146 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  37.66 
 
 		 1013 aa  612  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  36.01 
 
 		 1037 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 		 1155 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.58 
 
 		 1161 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1102 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 1144 aa  581  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 979 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1114 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1147 aa  572  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  36.74 
 
 		 993 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 1096 aa  562  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1177 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.45 
 
 		 1117 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1048 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1038 aa  536  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1077 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1168 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1181 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1122 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1042 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1017 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1038 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1128 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 1050 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1148 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 1008 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1097 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1124 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1116 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 1037 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 996 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 1000 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1079 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1006 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1008 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1152 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1132 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 986 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 982 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1042 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 1029 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1163 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1006 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1051 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1034 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.07 
 
 		 1041 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1028 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1050 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 1019 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1105 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 986 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1179 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1027 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1154 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 1026 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.48 
 
 		 1023 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1127 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1177 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1023 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 989 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1071 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1023 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1057 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1161 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1012 aa  433  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1034 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 994 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1058 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1076 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1039 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1010 aa  433  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1010 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1154 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1103 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1119 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1006 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 1128 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1173 aa  425  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.88 
 
 		 1030 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1066 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1076 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 996 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1039 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1202 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1155 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1150 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1041 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1053 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1116 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1192 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1102 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1071 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1120 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1076 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1079 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>