More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4255 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1034 aa  2095    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 1096 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1077 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1017 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1006 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1034 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1102 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 1144 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 986 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 996 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1161 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1155 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1155 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1038 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1038 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1051 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1147 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1076 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1071 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 1050 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1076 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1008 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1042 aa  443  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1079 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  32.93 
 
 		 1080 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1168 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1013 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 1000 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1114 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1117 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1132 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 1029 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 979 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1163 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1039 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1033 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1037 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1023 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 		 1030 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1124 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1081 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1177 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1105 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1128 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1012 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1076 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 1005 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1049 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1008 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  30.21 
 
 		 1018 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1181 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1053 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1066 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1010 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1152 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1038 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 1071 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 1175 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1127 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1006 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 982 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 993 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1037 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 1019 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1059 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1039 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1060 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1040 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1148 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 1140 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1154 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1106 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1021 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1051 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1122 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1041 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1173 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1027 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1087 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1006 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 		 1023 aa  383  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.9 
 
 		 1063 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 1020 aa  383  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 1047 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1028 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1106 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1050 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 994 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 986 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 		 1043 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1003 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1057 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1154 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 989 aa  376  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1189 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1048 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1120 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1129 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1042 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1084 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>