More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4456 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  42.04 
 
 		 1006 aa  742    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1010 aa  2040    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  38.23 
 
 		 1031 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1003 aa  582  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 1010 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.09 
 
 		 1161 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 1026 aa  552  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1060 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.16 
 
 		 1012 aa  546  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1066 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1064 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1036 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 1008 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 1038 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 1037 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  35.34 
 
 		 1043 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 1029 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1181 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1177 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1082 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1114 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 982 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1155 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1127 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1062 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1085 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1006 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1124 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 1050 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1076 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 1177 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1004 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1076 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  34.09 
 
 		 1005 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.65 
 
 		 1023 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1202 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1189 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 1049 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1117 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1164 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1071 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1148 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1076 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 1130 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1075 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1051 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1039 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1023 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1038 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1116 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 986 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1175 aa  483  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 1077 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 1020 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1128 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 1033 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1084 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 1034 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1097 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.79 
 
 		 1063 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1079 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1179 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 996 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1031 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1155 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 1011 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 989 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1065 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 1144 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1041 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1122 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1161 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1051 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1147 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 1000 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1027 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1013 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1129 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.88 
 
 		 1002 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1192 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 1083 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1071 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1028 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 994 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1168 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1152 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1071 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1128 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 1025 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1137 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1132 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 996 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1047 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  32.38 
 
 		 1000 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1020 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1116 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1163 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1096 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1103 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>