More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4042 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  41.68 
 
 
1161 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1026 aa  2082    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  38.88 
 
 
1023 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  42.25 
 
 
1012 aa  687    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  38.5 
 
 
1155 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 
1033 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  38.07 
 
 
1020 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  37.98 
 
 
1037 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  38.96 
 
 
1038 aa  623  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  38.81 
 
 
1177 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  38.4 
 
 
1164 aa  622  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  38.51 
 
 
1066 aa  615  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  39 
 
 
1127 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  38.61 
 
 
1008 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.21 
 
 
1124 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  36.99 
 
 
1036 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  37.73 
 
 
1116 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 
1177 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.98 
 
 
1029 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 
982 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 
1082 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  37.04 
 
 
1122 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 
1050 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.93 
 
 
1181 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  38.59 
 
 
1097 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 
1128 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 
1139 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  37.34 
 
 
1020 aa  575  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  37.72 
 
 
1026 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 
1064 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  36.77 
 
 
1043 aa  564  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.65 
 
 
989 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.59 
 
 
1148 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  36.55 
 
 
1039 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  37.17 
 
 
986 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  35.76 
 
 
1062 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 
1034 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 
1192 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 
1114 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 
1117 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 
1103 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  35.61 
 
 
1085 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 
1031 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 
1006 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.94 
 
 
1063 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 
1010 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.76 
 
 
1052 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 
1079 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 
1130 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  36.25 
 
 
1081 aa  549  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 
1013 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 
1155 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
1065 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 
1011 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.7 
 
 
1071 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  36.99 
 
 
1023 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 
1150 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 
1023 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
1049 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 
1027 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 
1000 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  36.1 
 
 
1132 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 
1175 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 
1079 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 
1128 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  35.7 
 
 
1129 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 
1168 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 
1161 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 
1019 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  36.35 
 
 
1005 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  35.3 
 
 
1002 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 
1058 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 
1040 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 
1038 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 
1131 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 
1060 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 
1071 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 
1047 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 
1075 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  36.6 
 
 
1179 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 
1006 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 
1060 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
1055 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  35.99 
 
 
1036 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 
1051 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 
1189 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 
1028 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 
1071 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 
1034 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 
1010 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  36.16 
 
 
1031 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.53 
 
 
1041 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  35.65 
 
 
1163 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 
1014 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 
1146 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 
1130 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 
1003 aa  502  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 
1025 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 
1144 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 
996 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>