More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0196 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1034 aa  2109    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  39.58 
 
 		 1020 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 1036 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 1026 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1131 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1026 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1064 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1127 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1138 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1130 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1012 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1146 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 989 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1019 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1013 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1031 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1095 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1046 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 1064 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1155 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1079 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 1144 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 1033 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1082 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1161 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1168 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1045 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 982 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1177 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 986 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1062 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.43 
 
 		 1043 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 1086 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1095 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1085 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 		 1005 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1164 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1052 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1202 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1181 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 1189 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1148 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1124 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1084 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1060 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1056 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1066 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1006 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1164 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1188 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1020 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 1175 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1037 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 1049 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.42 
 
 		 1002 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1077 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1036 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1053 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1045 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1116 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1011 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 994 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1139 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 979 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 1010 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1013 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1023 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1008 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1038 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1033 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1066 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1047 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1096 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1036 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1038 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1071 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 996 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1128 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1004 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1079 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1173 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1147 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1040 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1028 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 1061 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1058 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1071 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 1050 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1051 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1114 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1217 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1056 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1010 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 1177 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  30.1 
 
 		 1047 aa  373  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1053 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 1041 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1006 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1128 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>