More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3371 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1036 aa  2087    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  50.55 
 
 		 1013 aa  1014    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 1127 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 1130 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 1034 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1019 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1026 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 1026 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1020 aa  506  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 1131 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1146 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1066 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1168 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1181 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1031 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1045 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 1033 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1161 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 1037 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1155 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.66 
 
 		 1041 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 1020 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1038 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 1056 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1144 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1164 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1177 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1050 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1139 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1138 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1027 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1142 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1024 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1046 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1079 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1116 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 989 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1039 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1116 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1023 aa  423  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 986 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1029 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1039 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1173 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 1011 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1109 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1006 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1086 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 982 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1006 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.89 
 
 		 1023 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1061 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1010 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1036 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1124 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1114 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1217 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 1177 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1095 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1128 aa  403  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1028 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1038 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1031 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1147 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1004 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1130 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1097 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 1093 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 		 1005 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1079 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1148 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1188 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1071 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1066 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1051 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1094 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 953 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1053 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1012 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1164 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1036 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1096 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1060 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1132 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1084 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1047 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1129 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1049 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1025 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1028 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 1000 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1172 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1023 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1017 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1058 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 1019 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 1063 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1006 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1056 aa  380  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1075 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>