More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2530 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1146 aa  2341    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  37.07 
 
 		 1139 aa  667    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1131 aa  628  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1127 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 1130 aa  559  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1138 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1031 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1164 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1168 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1026 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 1093 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1013 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1020 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1132 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1026 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1019 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1024 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1142 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 1177 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1129 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1123 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1217 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1188 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1034 aa  477  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1192 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1036 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1045 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1116 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1155 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 1140 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1124 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1161 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1190 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1114 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1163 aa  453  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1012 aa  449  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1038 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1064 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 1189 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1037 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1128 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1056 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1164 aa  443  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1144 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1066 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1128 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1202 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1082 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1147 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1139 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1046 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1079 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 989 aa  428  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1177 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1075 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1036 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1154 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1036 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1097 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 1020 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1175 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1064 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1060 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.32 
 
 		 1023 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1109 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1052 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1077 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 1033 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1181 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1036 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1116 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1086 aa  410  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1145 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1101 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 1029 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1003 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1084 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 1041 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1047 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1053 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1061 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1130 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1104 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1045 aa  400  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 1038 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.83 
 
 		 1043 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 1011 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1117 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1173 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1100 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1095 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1122 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1004 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1008 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1154 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1049 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 1050 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1179 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1085 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1134 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>