More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2249 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1190 aa  2437    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  38.14 
 
 		 1120 aa  754    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  40.43 
 
 		 1075 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  50.14 
 
 		 1100 aa  1054    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  48.77 
 
 		 1104 aa  998    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  49.62 
 
 		 1077 aa  1024    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  37.6 
 
 		 1217 aa  768    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 1188 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  36.13 
 
 		 1045 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1064 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  32.88 
 
 		 1095 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1139 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1127 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1131 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1146 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1164 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1024 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1031 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1168 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1163 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1138 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1177 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1134 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1013 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1124 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1037 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 1128 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1020 aa  393  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1147 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1114 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1155 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1161 aa  390  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1123 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 1130 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1192 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1026 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1140 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1129 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1181 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1142 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1154 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1036 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1117 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1132 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 1093 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1038 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 1038 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1144 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1097 aa  367  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 986 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1076 aa  365  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1066 aa  365  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1122 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1076 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1173 aa  360  8e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 1033 aa  360  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 989 aa  359  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1039 aa  357  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1076 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1012 aa  353  8e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1006 aa  353  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1020 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1148 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1053 aa  352  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1109 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1050 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1152 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1051 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1145 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1019 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1128 aa  345  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 1045 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1176 aa  343  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 		 1063 aa  343  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1079 aa  343  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1143 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1081 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1148 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1096 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1010 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1071 aa  338  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1079 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 1144 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 1177 aa  334  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1155 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  29.06 
 
 		 1005 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.74 
 
 		 1023 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1028 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1023 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1000 aa  331  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1056 aa  330  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 982 aa  330  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1102 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1008 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1095 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1128 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1164 aa  327  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1042 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1086 aa  326  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1006 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>