More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4559 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  40.04 
 
 		 1086 aa  763    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  39.85 
 
 		 1079 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  42.67 
 
 		 1095 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  66.41 
 
 		 1056 aa  1399    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  40.53 
 
 		 1095 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 1046 aa  713    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1033 aa  2095    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 		 1045 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1006 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 1061 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 1144 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1047 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1026 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1123 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1127 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1031 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 1026 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1109 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1027 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1020 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1036 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1168 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 1130 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1013 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1131 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1074 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1036 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1062 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1029 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1130 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1034 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1056 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1155 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1086 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1128 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1055 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1128 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1019 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1058 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1065 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 1020 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1148 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1094 aa  426  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1018 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1145 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1066 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1138 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1060 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1004 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1011 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1068 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1181 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1142 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1146 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1161 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1116 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1056 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1053 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1036 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1033 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1049 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 937 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1006 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1052 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1036 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1081 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1037 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 953 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1064 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 1071 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1188 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 		 1043 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1148 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 1029 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1164 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1177 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1038 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1008 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1043 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 1050 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1217 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1010 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1031 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1006 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1082 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1148 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1177 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1064 aa  380  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 1033 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1114 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1164 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1137 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1139 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1042 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1025 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1028 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 1038 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1048 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 979 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1012 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>