More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4504 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1074 aa  2199    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1047 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1148 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 1065 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1128 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1055 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1086 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 1033 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1079 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 1056 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1128 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1095 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1046 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1095 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1036 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1127 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1109 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1006 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1045 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1144 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1027 aa  361  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1026 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 1061 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1053 aa  353  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1029 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1036 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1094 aa  348  5e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1188 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1036 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 1130 aa  344  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1058 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1026 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 1029 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1130 aa  327  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1039 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 953 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1020 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1155 aa  323  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1020 aa  321  5e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1123 aa  320  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1145 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1181 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 913 aa  318  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1060 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1124 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1164 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1056 aa  314  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1217 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1131 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1024 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1163 aa  310  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1161 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1034 aa  310  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1006 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1104 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1142 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1008 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1019 aa  304  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1086 aa  304  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1012 aa  304  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1033 aa  303  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1031 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 1018 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1100 aa  303  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1028 aa  303  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1064 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1058 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1146 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 1043 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1168 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1177 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 994 aa  297  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 1049 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1132 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1066 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1050 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1039 aa  292  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 979 aa  291  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1052 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1148 aa  290  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 1023 aa  290  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1045 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1013 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1006 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1036 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  28.13 
 
 		 1002 aa  288  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1175 aa  289  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1147 aa  288  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 1025 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1189 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1011 aa  287  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1173 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 937 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1071 aa  285  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1139 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1062 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1082 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1037 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1116 aa  282  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1056 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>