More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4287 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  47.03 
 
 		 1128 aa  967    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  60.87 
 
 		 1055 aa  1329    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1065 aa  2174    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  48.35 
 
 		 1148 aa  953    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 1047 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1074 aa  536  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 1056 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1033 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1095 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1095 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1086 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1079 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1128 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1046 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1026 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1006 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1144 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1155 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1138 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1127 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1130 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1026 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1168 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1020 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1109 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1130 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1010 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1031 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1008 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1128 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1006 aa  363  9e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1019 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1061 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1145 aa  361  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 982 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1148 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1053 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1060 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1027 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1056 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1064 aa  353  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1029 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 1037 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1161 aa  350  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1131 aa  350  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1050 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1096 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1006 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1029 aa  348  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1036 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1079 aa  347  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1177 aa  344  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1006 aa  343  7e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1128 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1036 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1217 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1189 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1188 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1179 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 1020 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1017 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1018 aa  337  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1181 aa  337  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1142 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1042 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1129 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1045 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1175 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1052 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1192 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1104 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1152 aa  331  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1161 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1039 aa  331  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 989 aa  330  6e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1084 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 986 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1123 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1066 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1051 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1146 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1038 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1027 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1064 aa  325  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1004 aa  326  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1102 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1077 aa  325  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1058 aa  325  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 1038 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1049 aa  323  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1173 aa  322  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1079 aa  320  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1013 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1082 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1028 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1058 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 979 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1076 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 1023 aa  315  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1139 aa  314  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>