More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0356 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1128 aa  2303    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  43.04 
 
 		 1055 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  46.74 
 
 		 1065 aa  951    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  57.62 
 
 		 1148 aa  1379    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 1047 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1074 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1144 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1128 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1033 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1127 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1155 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1086 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1109 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1130 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1056 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1138 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1188 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1079 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 1061 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1161 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1095 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1095 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1148 aa  390  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1131 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1217 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 1026 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1123 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1020 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1164 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1046 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1189 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1179 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1006 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1142 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1106 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1036 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1168 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1045 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1139 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1145 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1027 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1202 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1096 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1097 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1122 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1026 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1128 aa  358  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1117 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1181 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1192 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1013 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1176 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1058 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1019 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1020 aa  348  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1006 aa  347  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1163 aa  347  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1177 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1056 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1060 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1029 aa  345  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1168 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1011 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1037 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1053 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1140 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1102 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1086 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1018 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1130 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1094 aa  336  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 1144 aa  337  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1056 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1066 aa  336  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1031 aa  333  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1004 aa  331  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1116 aa  330  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1177 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1119 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1079 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1129 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1039 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1177 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 1005 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1139 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1160 aa  320  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1077 aa  320  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1024 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1006 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1137 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1087 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1008 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1036 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1033 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1036 aa  317  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 1023 aa  313  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1010 aa  314  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 1033 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1042 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1034 aa  312  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>