More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1800 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1058 aa  2177    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  36.93 
 
 		 1048 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 1042 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  29.45 
 
 		 1123 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 1033 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1079 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 1086 aa  423  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 1061 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1144 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 1056 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1046 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1095 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1095 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1036 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1127 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1013 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 1130 aa  365  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1047 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1031 aa  363  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1037 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1161 aa  360  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1168 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1181 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 1026 aa  353  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1024 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1128 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1026 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 996 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1020 aa  344  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1128 aa  343  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1025 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1036 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1142 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1147 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1066 aa  337  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1045 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1020 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1074 aa  337  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1038 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1029 aa  334  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1124 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 1000 aa  332  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1128 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1148 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 982 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1064 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1109 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1053 aa  328  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1039 aa  327  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 994 aa  327  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1079 aa  325  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 979 aa  325  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1050 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1050 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1075 aa  324  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1027 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1177 aa  323  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 986 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1008 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1131 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1148 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1164 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1028 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1006 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1123 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1146 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1094 aa  320  9e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1034 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1036 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1017 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1163 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1036 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 996 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1217 aa  317  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1029 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1071 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1033 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1154 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1114 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1065 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1060 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1076 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1079 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1051 aa  313  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1058 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1175 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 989 aa  311  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1087 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1188 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 999 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 1128 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1084 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1004 aa  308  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1055 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1027 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1080 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 1071 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1116 aa  307  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1139 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1103 aa  307  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>