More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1845 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1128 aa  2310    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1144 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 1045 aa  493  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1148 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1095 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1047 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1079 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1095 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1046 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1033 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 1086 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1127 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1128 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 1056 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1109 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1027 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1131 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1074 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1036 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1139 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1130 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1155 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1188 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 1061 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 1065 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1123 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1019 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1217 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1036 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1145 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1202 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1013 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1006 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1130 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1148 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1026 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1176 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1189 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1168 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1026 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1018 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1128 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1056 aa  383  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1024 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1103 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1049 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1053 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1036 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1029 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1020 aa  373  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1031 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1164 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1102 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1161 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1177 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1034 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1146 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1116 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 1144 aa  363  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1179 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1055 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1114 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.58 
 
 		 1177 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1060 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1011 aa  358  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1161 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1020 aa  357  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1097 aa  357  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1006 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1096 aa  354  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1066 aa  354  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1122 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1138 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1010 aa  351  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1029 aa  351  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1045 aa  350  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1192 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1139 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1037 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1168 aa  347  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 937 aa  347  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1075 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1043 aa  344  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1033 aa  344  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1068 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1082 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1117 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1132 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1124 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1181 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1190 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1079 aa  341  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1058 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 953 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1038 aa  337  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1036 aa  337  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1147 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1062 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 982 aa  335  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1064 aa  334  5e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>