More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4101 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  45.22 
 
 		 1086 aa  918    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  55.35 
 
 		 1056 aa  1123    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  64.24 
 
 		 1062 aa  1334    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 		 1130 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  55.62 
 
 		 1176 aa  1135    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  48.49 
 
 		 1081 aa  985    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  50.19 
 
 		 1148 aa  984    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1068 aa  2191    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1006 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 1033 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1123 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1109 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1036 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1027 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1094 aa  449  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1043 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1144 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1056 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1145 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 1061 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1029 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 1045 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 1033 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1056 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 1018 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 953 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 1086 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1079 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1046 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 937 aa  367  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1026 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1093 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1155 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1142 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1095 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1020 aa  349  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1095 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1217 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1013 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1128 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1130 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1138 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1188 aa  336  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1047 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1025 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 913 aa  330  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1124 aa  327  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1038 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1168 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1038 aa  321  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1036 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1161 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1060 aa  317  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1131 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1148 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1058 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1181 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1192 aa  310  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1117 aa  310  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1050 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1019 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1033 aa  307  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1010 aa  307  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1155 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 982 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1179 aa  302  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1097 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1045 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1031 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.04 
 
 		 1019 aa  298  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1066 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1053 aa  297  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.58 
 
 		 1011 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1148 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1079 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 929 aa  294  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1100 aa  294  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1163 aa  293  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1038 aa  293  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1128 aa  293  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1010 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1085 aa  291  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1075 aa  291  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1000 aa  291  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1175 aa  291  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1036 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1023 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1062 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1146 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1012 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1164 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1082 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1028 aa  288  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1037 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1128 aa  287  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1144 aa  287  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 989 aa  286  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1102 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1129 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1020 aa  284  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>