More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1298 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  41.46 
 
 		 1025 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  42.65 
 
 		 913 aa  740    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 929 aa  1881    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 953 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 937 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1109 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1036 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1027 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1123 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1006 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1029 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1033 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1018 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1094 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1130 aa  343  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1145 aa  333  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1056 aa  330  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1062 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 917 aa  321  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1061 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1026 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1086 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1036 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1056 aa  310  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1056 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1043 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 1081 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1144 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1033 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1045 aa  300  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1013 aa  291  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1068 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1176 aa  290  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1146 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1047 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 1086 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1127 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 1093 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1181 aa  281  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1020 aa  275  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1019 aa  274  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1148 aa  273  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1046 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1074 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1095 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1095 aa  271  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1026 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1164 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1138 aa  267  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1038 aa  267  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1177 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1079 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1066 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1038 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1128 aa  257  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1130 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1128 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 1177 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1139 aa  250  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1060 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1031 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1024 aa  247  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1039 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1128 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1004 aa  246  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 1050 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1168 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1117 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1058 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1052 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1011 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 		 1023 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1029 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1036 aa  237  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1096 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1116 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1064 aa  236  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1122 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1079 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1147 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 1037 aa  230  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1152 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1034 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1139 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1114 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1028 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1164 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1097 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1071 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1034 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 1000 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1175 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 1065 aa  220  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1190 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1036 aa  218  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1137 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 1025 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1060 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1006 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 1192 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>