More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1020 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 917 aa  1877    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 937 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 913 aa  360  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1109 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1027 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 953 aa  339  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1145 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1036 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1056 aa  320  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1006 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 929 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1094 aa  307  6e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1086 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1123 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1033 aa  293  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1025 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1029 aa  290  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1130 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1079 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1033 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 1018 aa  277  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1095 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1046 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1081 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1176 aa  269  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1095 aa  267  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 1130 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1128 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1068 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1013 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 1061 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1026 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1062 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1043 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1148 aa  241  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1144 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1056 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1066 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 1093 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1039 aa  230  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 1086 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1161 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1036 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1047 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1031 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1138 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1038 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1155 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1012 aa  215  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1026 aa  214  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1164 aa  213  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 1011 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 1049 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1168 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1173 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1060 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1077 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1004 aa  197  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 1128 aa  197  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 1023 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1127 aa  195  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1177 aa  195  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1066 aa  195  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1064 aa  194  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1062 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1164 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1132 aa  193  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 1019 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1074 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1036 aa  191  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1139 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 1038 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1075 aa  188  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1117 aa  187  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1038 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1150 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 1003 aa  186  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 1063 aa  184  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1058 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  25.8 
 
 		 1002 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 1037 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1114 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2103  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 966 aa  182  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.994808  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 1045 aa  181  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1179 aa  178  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 1000 aa  177  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 1056 aa  177  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1006 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1064 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  22.78 
 
 		 1188 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1036 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 1148 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1053 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 1052 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1041 aa  171  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1023 aa  170  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 1075 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1139 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1006 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 1175 aa  168  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>