More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6796 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  48.49 
 
 		 1068 aa  974    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  49.1 
 
 		 1056 aa  938    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  56.29 
 
 		 1148 aa  1178    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  42.42 
 
 		 1086 aa  821    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  50.05 
 
 		 1062 aa  997    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  47.89 
 
 		 1176 aa  964    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1081 aa  2212    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1033 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1130 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 1006 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1123 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1043 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 1018 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1094 aa  432  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1056 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1145 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1029 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1036 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1027 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1109 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 953 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1033 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1045 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 937 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1144 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1056 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1086 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 1061 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1020 aa  357  5e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 1025 aa  350  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1095 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1131 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1026 aa  345  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 913 aa  344  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 1130 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1038 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1138 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1031 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1155 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 1093 aa  330  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1046 aa  330  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1190 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1095 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1036 aa  326  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1142 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1168 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1012 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1047 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1013 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1188 aa  316  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1146 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1050 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1038 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 929 aa  304  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1148 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1079 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1192 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1026 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1052 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1217 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1071 aa  294  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1104 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1128 aa  293  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1034 aa  293  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1181 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.58 
 
 		 1043 aa  288  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1066 aa  287  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1139 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1024 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1132 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1128 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1029 aa  281  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1028 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  26.93 
 
 		 1095 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1071 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1137 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1173 aa  278  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1148 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1049 aa  278  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1014 aa  278  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1164 aa  277  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1119 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1177 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1010 aa  275  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1161 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 917 aa  272  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1140 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1074 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 999 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1160 aa  271  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 1177 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1065 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 986 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1033 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.01 
 
 		 1023 aa  268  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1006 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 1063 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1058 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1075 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.78 
 
 		 1019 aa  265  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>