More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1589 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1164 aa  2392    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1139 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1146 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1026 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 1130 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1142 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1168 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1031 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1024 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1138 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1161 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 1144 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1013 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1155 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 1026 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1139 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1131 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1020 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1181 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1114 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1217 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1188 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1116 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 1128 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1036 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1012 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1124 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1177 aa  433  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1190 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1117 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1038 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 1037 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1046 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1164 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1029 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1079 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1189 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1128 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 1093 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.68 
 
 		 1043 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1019 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1061 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1202 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 1177 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1036 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.37 
 
 		 1063 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1036 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 1045 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1132 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1106 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1100 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1102 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1034 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 1049 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1144 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1064 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1147 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1129 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1192 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1122 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1154 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1060 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1082 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 986 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1047 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1075 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1096 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1123 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1066 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1006 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1095 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1095 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1075 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1038 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1086 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1175 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1058 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1104 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1077 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1050 aa  380  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1161 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1019 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1010 aa  380  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1062 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 982 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1000 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.41 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 996 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1168 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1029 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1033 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1006 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1179 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1085 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1154 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1173 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1056 aa  370  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1116 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1064 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>