More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2667 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1093 aa  2226    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1146 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 1130 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1031 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1116 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1155 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1168 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1139 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1138 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1013 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1020 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1127 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 1026 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1124 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1164 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1019 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1026 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1148 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1020 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1036 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1123 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1192 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1038 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1161 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1132 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1148 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1097 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 1144 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1163 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1064 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1036 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1060 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1175 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 1011 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1176 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1000 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1122 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1082 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1037 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1008 aa  380  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1077 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 1177 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1190 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1039 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1114 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1006 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1128 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1202 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1142 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1217 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1085 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1010 aa  366  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1024 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1062 aa  365  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1181 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1068 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1062 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 1056 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1129 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1109 aa  362  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 1033 aa  361  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1029 aa  360  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1006 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1084 aa  357  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1071 aa  357  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1013 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 1050 aa  356  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1179 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1038 aa  356  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 1061 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 1189 aa  353  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1006 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 1140 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1028 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1079 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1012 aa  352  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1188 aa  350  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1066 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1152 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1173 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1017 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 996 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1064 aa  348  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1004 aa  348  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1042 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1117 aa  347  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 1005 aa  347  8.999999999999999e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 979 aa  346  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1128 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1139 aa  344  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1052 aa  344  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1047 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1031 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1164 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1023 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1040 aa  341  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1081 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1036 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>