More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5486 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  41.26 
 
 		 1139 aa  837    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1147 aa  2357    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 1024 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1188 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1217 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1146 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1130 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1164 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 1026 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1075 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1045 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1026 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1127 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1190 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1019 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1045 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1013 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1020 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1155 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1031 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1036 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1168 aa  351  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1138 aa  351  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1064 aa  350  8e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1144 aa  350  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1104 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1131 aa  346  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1128 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1128 aa  340  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1097 aa  338  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1128 aa  337  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1100 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1077 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1109 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1029 aa  325  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1094 aa  325  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1117 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1123 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 1033 aa  317  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 1020 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1130 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1006 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1114 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1139 aa  315  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1012 aa  314  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1120 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1116 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1029 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1192 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1175 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1037 aa  305  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1181 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1038 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1134 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1161 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1177 aa  297  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1053 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1011 aa  294  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1036 aa  294  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  27.98 
 
 		 1043 aa  293  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1129 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1006 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 1140 aa  290  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 989 aa  290  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1119 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1052 aa  290  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1102 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1027 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1010 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1086 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1095 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 986 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1202 aa  284  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1150 aa  284  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1144 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1061 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 1093 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1049 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1145 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1164 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1033 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1095 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1036 aa  280  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1161 aa  280  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1034 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 953 aa  277  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1017 aa  275  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1147 aa  274  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1039 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1132 aa  272  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1023 aa  271  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1050 aa  270  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1042 aa  270  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1081 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1028 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1006 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1043 aa  268  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1047 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 1065 aa  267  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1179 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>