More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1683 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  38.09 
 
 		 1188 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1045 aa  2137    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  38.94 
 
 		 1217 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  37.51 
 
 		 1075 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  36.65 
 
 		 1100 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1190 aa  613  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 1104 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1077 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1064 aa  559  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  34.23 
 
 		 1095 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1120 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 1130 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1024 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1139 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1127 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1020 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1026 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 1026 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1168 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1013 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1034 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1146 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1019 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1147 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1131 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 982 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1012 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1161 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1036 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1138 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1202 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1082 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1060 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 1050 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1128 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 1189 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1010 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1181 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1142 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1094 aa  386  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 1175 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1036 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1079 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1062 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 986 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1087 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1075 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1038 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1011 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1144 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 1033 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1085 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1095 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1064 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1047 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 989 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1045 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1020 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1148 aa  363  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1046 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1192 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1036 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1164 aa  357  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 1056 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1099 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1006 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1058 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1017 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1128 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1173 aa  353  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1095 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1128 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1008 aa  350  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1006 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 996 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1079 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 994 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1053 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1066 aa  347  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1179 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1155 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1047 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1004 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1076 aa  346  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 		 1063 aa  345  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1006 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1027 aa  344  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1062 aa  343  8e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1147 aa  343  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1116 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1079 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1076 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 996 aa  341  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 1025 aa  340  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 1040 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1097 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1177 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1071 aa  337  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>