More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2241 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1027 aa  2092    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  47 
 
 		 1018 aa  907    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  47.59 
 
 		 1029 aa  934    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  94.53 
 
 		 1109 aa  1912    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  36.37 
 
 		 1036 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 1123 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1094 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1056 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 1006 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1145 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 913 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1033 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1130 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 953 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1033 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1086 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1176 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1079 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 1056 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1086 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1056 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1046 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1148 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1062 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 937 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1095 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1068 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 1045 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 1144 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1038 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1036 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1061 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 1025 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 929 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1081 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1128 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1047 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1026 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1031 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1155 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1127 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 1130 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1026 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1043 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1020 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1168 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1131 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1148 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1060 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1164 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1128 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1074 aa  363  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1161 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1139 aa  357  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 1049 aa  357  7.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1146 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1039 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 917 aa  350  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 1065 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1066 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1177 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1124 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1020 aa  341  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1138 aa  340  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1142 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1019 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1010 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 1029 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 1011 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1024 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1006 aa  330  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1038 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1202 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1058 aa  328  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1082 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1033 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1116 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1004 aa  327  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1217 aa  327  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1008 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1012 aa  325  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1071 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1042 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1079 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 1041 aa  320  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1173 aa  320  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1006 aa  320  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1071 aa  317  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1128 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 1093 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1045 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1081 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1096 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1064 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1164 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 1189 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 986 aa  311  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1028 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1096 aa  310  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1048 aa  310  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>