More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2476 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  56.55 
 
 		 1086 aa  1227    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1095 aa  2229    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  55.45 
 
 		 1079 aa  1181    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  40.11 
 
 		 1056 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  86.22 
 
 		 1095 aa  1935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  40.53 
 
 		 1033 aa  736    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  54.4 
 
 		 1046 aa  1167    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1127 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1047 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 1045 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1013 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 1144 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1006 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1036 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 1026 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1026 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1027 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 1130 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1109 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 1061 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1094 aa  459  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1128 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1168 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1056 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1020 aa  442  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1123 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1131 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1145 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1031 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1155 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1065 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1074 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1217 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1188 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1064 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1029 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1036 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1181 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1142 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 1018 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1055 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1164 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1082 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1058 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1130 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1128 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1006 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1139 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1036 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1037 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1066 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1148 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1164 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1024 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1019 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1038 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1062 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1146 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1161 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1011 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 1029 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1076 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1012 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1104 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1155 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1132 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1086 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1071 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1008 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 1140 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1051 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 989 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1076 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1060 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1050 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1085 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.97 
 
 		 1043 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1053 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 994 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1068 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1117 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1079 aa  364  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1031 aa  364  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1128 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 937 aa  360  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 1177 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1148 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1017 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1076 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1033 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1064 aa  356  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1048 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1039 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1004 aa  354  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1097 aa  354  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1042 aa  353  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1058 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1010 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>