More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2722 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 		 1144 aa  826    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1045 aa  2133    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  42.59 
 
 		 1061 aa  769    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 1033 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 1079 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1095 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 1056 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1006 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 1086 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1046 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1095 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1036 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1128 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1146 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1123 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1130 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1013 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1036 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1127 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1047 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1029 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1109 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1130 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1034 aa  446  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1026 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1027 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1026 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1033 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1062 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1056 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1086 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1139 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1145 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1131 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 1018 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 937 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1056 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1164 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1176 aa  413  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1068 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1188 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1161 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1020 aa  403  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 1189 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 996 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1081 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1138 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1036 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1010 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1202 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1175 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1006 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1094 aa  385  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1019 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 1037 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1084 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1008 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1066 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 994 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1024 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1168 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1060 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 1049 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1028 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1181 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1177 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 1020 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1217 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1128 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1147 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1039 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1074 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1025 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1192 aa  363  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 989 aa  363  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1055 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1097 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 1033 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1012 aa  360  7e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 953 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1003 aa  358  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1064 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1023 aa  357  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1177 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1152 aa  354  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1124 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1148 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1082 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1045 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1050 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 1002 aa  350  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 996 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1064 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 913 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 986 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1052 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 982 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1053 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1148 aa  343  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>